Corre el año 2089. Los arqueólogos Elizabeth Shaw y Charlie Holloway descubren un mismo mapa estelar en escrituras de distintas culturas antiguas sin posibilidad de contacto entre ellas. Interpretan el mensaje como una invitación de los precursores o diseñadores de la humanidad, o «Ingenieros» como ellos los llaman, a visitar un sistema planetario específico señalado en el mapa. Peter Weyland, el anciano fundador y dueño de la Corporación Weyland, reúne fondos para la creación y lanzamiento de la nave científica Prometheus, con el objeto de viajar hasta la luna distante LV-223, la única habitable en el sistema planetario del mapa. La tripulación de la nave viaja en hipersueño mientras el androide David se encarga de que el viaje siga su curso, entreteniéndose viendo películas del siglo XX o estudiando obras de lingüística.
Llegan al planetoide durante la Navidad de 2093. Shaw y Holloway explican al resto de la tripulación las características de la misión, consistente en encontrar a los Ingenieros. La directora de la misión, Meredith Vickers, les ordena que eviten cualquier toma de contacto sin su permiso. Prometheus aterriza cerca de una gran estructura artificial, que explora una parte del equipo.